Jepang akan merayakan festival olahraga terbesar di dunia, “WSG-World Sports Games”, di Tokyo. Sejalan dengan upacara pembukaan, diumumkan bahwa kereta “Vacuum Superconducting Linear” pertama di dunia, dengan kecepatan maksimum 1.000 km/jam yang menggabungkan semua teknologi Jepang, akan dibuka untuk umum antara Stasiun Shin-Nagoya dan Stasiun Shibahama dan beroperasi di Tokyo. Ketika perhatian dunia tertuju pada kereta ini, sebuah insiden terjadi di sebuah tempat pesta di mana para sponsor turnamen terkenal berkumpul, yang mengarah pada situasi yang tidak normal di mana para petinggi perusahaan diculik satu demi satu. Di belakang layar ada Shuichi Akai yang memantau kejadian tersebut, dan FBI yang menunggu perintah dari Akai.
Alasan Conan mengungkapkan relevansi insiden penculikan WSG apokaliptik yang terjadi di Boston, Amerika Serikat, lima belas tahun yang lalu, dan bahwa insiden tersebut juga berada di bawah yurisdiksi FBI. Apakah ini suatu kebetulan? Apa yang akan terjadi di Jepang, tempat berkumpulnya berbagai jenis orang dari seluruh dunia?
