Shibuya, Tokyo, sedang ramai dengan musim Halloween. Sebuah pernikahan diadakan di Shibuya Hikarie, di mana Sato mengenakan gaun pengantin. Sementara Conan dan tamu undangan lainnya menonton, seorang penyerang tiba-tiba menyerbu masuk, dan Takagi, yang berusaha melindungi Sato, terluka. Takagi selamat dan situasinya telah diselesaikan, tetapi di mata Sato, bayangan malaikat maut yang dia lihat ketika Jinpei Matsuda, pria yang dia cintai, terbunuh dalam serangkaian pengeboman tiga tahun yang lalu, tumpang tindih dengan bayangan Takagi.
Pada saat yang sama, pelaku pengeboman melarikan diri dari penjara. Rei Furuya/Toru Amuro, seorang anggota polisi keamanan publik, memburu orang yang membunuh teman sekelasnya, tetapi seseorang yang menyamar tiba-tiba muncul dan meletakkan bom kerah padanya.
Conan mengunjungi tempat penampungan bawah tanah tempat Amuro bersembunyi untuk melucuti bom kerah tersebut, dan mendengar tentang kejadian tiga tahun lalu ketika dia dan teman sekelasnya yang sekarang sudah meninggal dari akademi kepolisian bertemu dengan seorang pengebom virtual tak dikenal bernama “Plamya” di Shibuya. Saat Conan dan timnya menyelidiki, bayangan yang mengganggu mulai membayangi mereka.
