Sehabis kehancuran kampung taman mereka, sahabat masa kecil Kafka Hibino serta Mina Ashiro membuat perjanjian buat jadi perwira di Pasukan Pertahanan-sebuah organisasi militer yang ditugaskan buat melindungi Jepang dari monster kolosal yang diketahui selaku “kaijuu.” Puluhan tahun setelah itu Kafka yang berumur 32 tahun sudah menyerah pada mimpinya selaku seseorang pahlawan. Selaku gantinya, ia mensterilkan sisa-sisa kaijuu yang sudah dibantai sehabis mereka dikalahkan oleh para prajurit yang gagah berani-termasuk Mina, yang sudah sukses menggapai tujuan bersama mereka.
Dikala berjumpa dengan rekan kerja barunya, Reno Ichikawa, Kafka mengalami kaca masa lalunya: seseorang pemuda ambisius yang mempunyai satu kemauan buat bertempur selaku anggota Pasukan Pertahanan. Sayangnya, keduanya lekas ikut serta dalam pertemuan aneh dengan seseorang kaijuu bandel Walaupun Kafka menampilkan watak kepahlawanan bawaannya serta menyelamatkan Reno dari malapetaka, ia terluka parah.
Kala keduanya pulih di rumah sakit, Kafka nyatanya diserbu oleh salah satu monster yang lain Selaku hasilnya, ia memperoleh keahlian buat berganti jadi kaijuu humanoid dengan kekuatan serta kekuatan monster besar yang mengecam Jepang. Dijuluki “Kaijuu Nomor 8” oleh militer, Kafka berniat buat memakai keahlian barunya demi kebaikan yang lebih besar. Terikat oleh rasa bersama menghormati, Kafka serta Reno berangkat buat bergabung dengan para pejuang semacam Mina di garis depan Pasukan Pertahanan.