Sudah dua setengah tahun sejak Naruto Uzumaki meninggalkan Konohagakure, Desa Daun Tersembunyi, untuk berlatih secara intensif setelah kejadian yang memicu keinginannya untuk menjadi lebih kuat. Sekarang Akatsuki, organisasi misterius ninja nakal elit, semakin dekat dengan rencana besar mereka yang dapat mengancam keselamatan seluruh dunia shinobi.
Meskipun Naruto lebih tua dan kejadian-kejadian menyeramkan membayangi di depan mata, kepribadiannya tidak banyak berubah-masih cerewet dan kekanak-kanakan-meskipun sekarang dia jauh lebih percaya diri dan memiliki tekad yang lebih besar untuk melindungi teman-teman dan rumahnya. Apapun yang terjadi, Naruto akan terus berjuang demi apa yang penting baginya, bahkan dengan mengorbankan tubuhnya sendiri, dalam kelanjutan kisah tentang anak laki-laki yang ingin menjadi Hokage.
