Ditetapkan pada periode Joseon, ‘Royal Secret Inspector Joy’ berkisah tentang seorang inspektur rahasia kerajaan dan seorang wanita yang bercerai. Ra Yi Eon (Taecyeon) adalah pria cerdas namun santai yang ingin hidup sederhana. Dia tiba-tiba lulus ujian pegawai negeri dan direkrut sebagai agen rahasia kerajaan.
Di sisi lain, Kim Jo Yi (Kim Hye Yoon) adalah seorang wanita muda berjiwa bebas dan bersemangat yang ingin menceraikan suaminya yang kecanduan judi. Dia tidak takut menghadapi kritik meskipun perceraian dianggap aib selama periode Joseon.
Dua orang dengan kepribadian yang berlawanan bergabung untuk menyelidiki kasus-kasus yang terjadi di negara tersebut.
